Навчальний процес і наукові дослідження в Університеті забезпечують понад 2600 науково-педагогічних і педагогічних працівників, у тому числі біля 300 професорів і докторів наук, понад 1000 доцентів і кандидатів наук. До складу Університету входять такі структурні підрозділи:
навчально-наукові інститути; факультети; кафедри; науково-дослідні інститути, в тому числі:
• Український науково-дослідний інститут сільськогосподарської радіології; • Українська лабораторія якості і безпеки продукції АПК; • Науково-дослідний та проектний інститут стандартизації і технологій екобезпечної та органічної продукції (м. Одеса);
• Бережанський агротехнічний інститут (Тернопільська обл.) • Ніжинський агротехнічний інститут (Чернігівська обл.) • Ірпінський економічний коледж (Київська обл.) • Немішаївський агротехнічний коледж (Київська обл.) • Боярський коледж екології і природних ресурсів (Київська обл.) • Заліщицький аграрний коледж ім. Є.Храпливого (Тернопільська обл.) • Бобровицький коледж економіки та менеджменту ім. О. Майнової (Чернігівська обл.) • Мукачівський аграрний коледж (Закарпатська обл.) • Бережанський агротехнічний коледж (Тернопільська обл.) • Ніжинський агротехнічний коледж (Чернігівська обл.)
міжкафедральні навчальні лабораторії на базі:
• Бережанського агротехнічного інституту (Тернопільська обл.); • Лубенського лісотехнічного коледжу (Полтавська обл.); • Малинського лісотехнічного коледжу (Житомирська обл.); • Таращанського агротехнічного коледжу (Київська обл.); • Мукачівського аграрного коледжу (Закарпатсьська обл.); • Бобровицького коледжу економіки та менеджменту ім. О. Майнової (Чернігівська обл.);
навчально-дослідні господарства та дослідні станції:
• Агрономічна дослідна станція (Київська обл.); • Боярська лісова дослідна станція (Київська обл.); • Великоснітинське навчально-дослідне господарство ім. О.В.Музиченка (Київська обл.); • Навчально-дослідне господарство «Ворзель» (Київська обл.);
інші структурні підрозділи, у тому числі:
• Український навчально-науково-інноваційний центр новітньої сільськогосподарської техніки і технологій; • Ботанічний сад; • Навчально-наукове виробниче мисливське господарство; • спортивно-оздоровчий табір «Академічний» (Одеська область).
До структури Університету також входять підрозділи, що знаходяться на території АР Крим:
Південний філіал НУБіП України «Кримський агротехнологічний університет»; Прибрежненський аграрний коледж; Кримський агропромисловий коледж; Бахчисарайський коледж будівництва, архітектури та дизайну; Кримський технікум гідромеліорації та механізації сільського господарства; Навчально-дослідна станція гірського садівництва, виноградарства, садово-паркового і лісового господарства.