Заклад утворений 1921 року рішенням Липовецького повітового виконавчого комітету Рад як Іллінецька сільськогосподарська професійна школа. Заснований на державній формі власності.
У 1929 році агропрофшколу було перетворено в агрономічний технікум.
У 1964 році навчальний заклад реорганізовано в радгосп – технікум.
В 1998 році радгосп – технікум отримав статус державного аграрного технікуму з навчально – дослідним господарством.
В 2003 році Іллінецький державний аграрний технікум реорганізовано в Іллінецький аграрний технікум Вінницького державного аграрного університету за наказами: Міністерства аграрної політики України - №148 від 26.05.2003 року; Вінницького державного аграрного університету - № 192 від 13.06.2003 року.
На виконання наказу Мінагрополітики України від 20 липня 2004 року за № 260 за наказом Вінницького ДАУ від 22 липня 2004 року за № 108т «Про перейменування технікумів» Іллінецький аграрний технікум Вінницького державного аграрного університету перейменовано в Іллінецький коледж Вінницького державного аграрного університету.
Наказом Міністерства аграрної політики України від 20.02.2008 року №69 „Про внесення змін до наказів Мінагрополітики 26.05.2003 року №148 та від 20.07.2004 року №260” вищезгадані накази визнано такими, що не реалізовані, та Іллінецький коледж Вінницького ДАУ перейменовано в Іллінецький державний аграрний коледж. Відповідно, Іллінецькому державному аграрному коледжу повернуто статус юридичної особи, який підпорядкований Міністерству аграрної політики України.
З 2015 року Іллінецький державний аграрний коледж підпорядкований Міністерству освіти і науки України (розпорядження КМУ № 87-р від 4 лютого 2015 року).
