„Котовський професійний ліцей” створений на базі Ремісничого училища механізації сільського господарства №9 у 1956р.
Колективом училища за короткий час було збудовано нові навчальні кабінети, лабораторії і майстерні, створена необхідна навчально-матеріальна база. Розпочалася підготовка механізаторських кадрів для сільського господарства.
З роками розширюється перелік робітничих професій. Училище готує трактористів-машиністів широкого профілю, механіків-комбайнерів, трактористів-слюсарів, слюсарів з ремонту автомобілів і сільгоспмашин. Від міської влади навчальний заклад отримує 120 га землі, на якій майбутні механізатори орють, сіють, збирають високі врожаї. Але справжню практику учні проходили на цілинних землях в Казахстані, сумлінна праця яких неодноразово відмічалась в газетах „Целинное знамя” та „Целинный край”.
У 1961 році директором училища було призначено Павліченка Олексія Івановича, який пропрацював до на цій посаді до 1997 року.
Завдяки наполегливій праці колективу училище увійшло до числа кращих професійно-технічних навчальних закладів Одеської області і в 1964 році було нагороджено перехідним Червоним Прапором Одеського обласного управління ПТО.
У ході соціалістичного змагання сільських ПТУ Одещини і України у 1971р. Котовське ПТУ №9 завоювало 1-е місце і було нагороджено перехідним Червоним Прапором Ради Міністерств УРСР і Української Ради професійних спілок.
З 1989р. в училищі крім підготовки кваліфікованих робітників з професії „ТДНЗ ракторист-машиніст сільськогосподарського виробництва” відкрилась підготовка таких професій, як „Плодоовочівник”, „Бджоляр”, „Помічник машиніста електровозу”.
У 1997 році директором училища було призначено Новицького Василя Степановича. Під його керівництвом ПТУ № 39 стає багатопрофільним професійно-технічним навчальним закладом. Так протягом 2002 – 2009 років училище отримало ліцензії на право підготовки учнівської молоді ще за чотирма професіями, які користуються попитом на ринку праці, а саме: «Кухар», Пекар; кондитер», «Електрослюсар з ремонту устаткування розподільчих пристроїв», «Муляр; штукатур».
Наказом управління освіти і науки Одеської облдержадміністрації № 330-ОД від 27.07.2004 року училище реорганізовано в Котовський професійний ліцей; згідно наказу управління освіти і наукової діяльності № 122 від 08.11.2005 року ліцей перейменовано на державний професійно-технічний навчальний заклад „Котовський професійний ліцей”.
Щороку педагогічні працівники та учні ліцею беруть активну участь у всіх заходах, які організовує управління (Департамент) освіти і науки облдержадміністрації та навчально-методичний центр ПТО в Одеській області:
— десять років поспіль ліцей посідає 1-е місце в обласному фестивалі-конкурсі «Чисті роси»;
— у 2008 р. ліцей посів І-е місце в обласних предметних олімпіадах із загальноосвітніх дисциплін;
— у 2007 та 2008 роках в обласних конкурсах фахової майстерності серед учнів професійно-технічних навчальних закладів Одеської області з професії «Тракторист-машиніст сільськогосподарського виробництва» учні ліцею посідали 3-є місце.
— у 2009 році - майстер виробничого навчання з професії «Пекар; кондитер» Петрів Н.А. стала переможцем у Всеукраїнському огляді-конкурсі «Робітнича професія - 2009»; - викладач математики Дирда Н.І. посіла 2-е місце в обласному конкурсі «Викладач року – 2010» у номінації «Математика»;
— у 2008 – 2013-х р.р. – учнівська команда КВК «Асорті» посідала призові місця у Всеукраїнському конкурсі-грі «КВК України» серед ПТНЗ Одеської області.
— у 2012 році учениця ліцею Іванцова В. посіла 2-е місце у ІІ етапі Всеукраїнського конкурсу робітничих професій серед учнів ПТНЗ з професії «Пекар», учениця Нікіфоряк О. посіла 1-е місце у обласній олімпіаді з математики
— у 2013 році учениця Семеніхіна А. посіла 2-е місце в обласній олімпіаді з української мови.
— у 2013 році викладач англійської мови Олійник І.П. посіла 2-е місце в обласному конкурсі «Викладач – року 2013» у номінації «Англійська мова»
З кожним роком удосконалюється навчально-матеріальна база ліцею, поліпшуються умови навчання.
Для забезпечення підготовки професій в ліцеї діють 27 навчальних кабінетів, 2 майстерні, 4 лабораторії, спортивна зала, навчальний полігон.
Ліцей має бібліотеку, клуб на 200 місць, їдальню на 100 місць.Створено і обладнано відповідною технікою комп’ютерний клас. Поступово навчальні класи оснащуються теле- та відеотехнікою для використання у навчальному процесі навчальних відеороликів, фільмів, презентацій.
Щороку до ліцею вступає на навчання за державним замовленням 200 учнів. В середньому учнівський контингент ліцею на початок навчального року налічує близько 600 осіб.
Педагогічним колективом ліцею приділяється велика увага виховній та позаурочній роботі з учнівською молоддю.
